絕大多數(shù)的微小GIST（直徑小于1cm的胃腸間質(zhì)瘤）可能會伴隨終生不會長大，因此沒有進行積極外科手術(shù)干預(yù)的指征。而對于小GIST（直徑小于2cm的胃腸間質(zhì)瘤），大多數(shù)在外科手術(shù)切除后病理結(jié)果提示的危險度分級多為極低度或低度危險，術(shù)后復(fù)發(fā)概率也很低（一般小于5%），因此絕大多數(shù)也并不需要進行伊馬替尼輔助治療，定期復(fù)查即可。GIST的術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移主要出現(xiàn)在中危或高危的患者中，因此根據(jù)GIST原發(fā)切除后改良NIH危險度分級，對切除術(shù)后病理結(jié)果提示危險度分級為中?；蛘吒呶５幕颊撸g(shù)后需要給予伊馬替尼輔助治療來降低復(fù)發(fā)風(fēng)險。

外科手術(shù)加伊馬替尼靶向治療已成為胃腸間質(zhì)瘤治療的標(biāo)準(zhǔn)模式。胃腸間質(zhì)瘤患者有可能會認(rèn)為一發(fā)現(xiàn)并確診了GIST應(yīng)該立即行外科手術(shù)切除，以解除心頭大患，但是對以下幾種特殊情況，專業(yè)醫(yī)師卻往往會建議患者先服用伊馬替尼，再行外科手術(shù)。j 術(shù)前難以達(dá)到完整切除。k 腫瘤體積巨大（>10cm），預(yù)估術(shù)中易破裂、出血，造成醫(yī)源性播散者。l 一些特殊部位的腫瘤（如胃食管結(jié)合部、十二指腸降部、低位直腸等），手術(shù)易損害重要臟器的功能。m 雖然腫瘤可以切除，但是估計手術(shù)風(fēng)險大，術(shù)后復(fù)發(fā)率、死亡率均較高者。n 估計需要實施多臟器聯(lián)合切除手術(shù)者。

胃腸間質(zhì)瘤的預(yù)后與腫瘤部位、大小、核分裂像、腫瘤術(shù)中是否完整切除、有無破裂以及基因突變類型等多種因素相關(guān)，但總體上預(yù)后較好。在靶向藥物伊馬替尼用于治療GIST之前，所有的可切除GIST患者的中位生存時間為66個月，5年生存率為54%。在靶向藥物伊馬替尼用于輔助治療手術(shù)切除后的中高危GIST后，根據(jù)一項包括歐洲4個國家24家醫(yī)院近400位接受手術(shù)切除的胃腸間質(zhì)瘤患者的隨機多中心臨床研究（SSGVXIII/AIO）表明，其總體5年生存率高達(dá)92%（術(shù)后服用伊馬替尼3年）和81.7%（術(shù)后服用伊馬替尼1年）。而且上述患者絕大多數(shù)都是腫瘤較大、核分裂像較多、術(shù)中腫瘤破裂的高復(fù)發(fā)風(fēng)險的患者，而如果可切除的胃腸間質(zhì)瘤患者根據(jù)病理結(jié)果被判斷為術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險極低或低度，則預(yù)后更好，基本可以認(rèn)為是被治愈。即使是晚期發(fā)現(xiàn)的胃腸間質(zhì)瘤患者，預(yù)后也較晚期胃癌或腸癌患者要好。根據(jù)美國和芬蘭的一項隨機、多中心的臨床研究（B2222）表明，晚期胃腸間質(zhì)瘤的中位生存時間為57個月，9年生存率達(dá)到35%。所以對于胃腸間質(zhì)瘤的患者來講，即使是晚期發(fā)現(xiàn)較大腫瘤，也應(yīng)以積極的心態(tài)配合治療，爭取獲得最佳療效。